Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atf3Q60765 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf3Q60765 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf3Q60765 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms