Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samhd1Q60710 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samhd1Q60710 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms