Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sik1Q60670 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sik1Q60670 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms