Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Tdrd5Q5VCS6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd5Q5VCS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Tdrd5Q5VCS6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd5Q5VCS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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