Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gprasp1Q5U4C1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gprasp1Q5U4C1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gprasp1Q5U4C1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms