Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc125Q5U465 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms