Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Trim38Q5SZ99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim38Q5SZ99 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim38Q5SZ99 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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