Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brip1Q5SXJ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brip1Q5SXJ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brip1Q5SXJ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms