Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Med13Q5SWW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med13Q5SWW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms