Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tsr1Q5SWD9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tsr1Q5SWD9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms