Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf1Q5ND28 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf1Q5ND28 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms