Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Kdm6bQ5NCY0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kdm6bQ5NCY0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms