Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
1810065E05RikQ5NC41 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms