Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttf2Q5NC05 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttf2Q5NC05 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms