Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clhc1Q5M6W3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clhc1Q5M6W3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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