Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Taf3Q5HZG4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Taf3Q5HZG4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms