Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx33Q4VAA7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms