Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp3Q499E0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp3Q499E0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms