Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp235Q499D5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zfp235Q499D5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp235Q499D5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms