Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx25Q3ZT31 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Snx25Q3ZT31 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Snx25Q3ZT31 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Snx25Q3ZT31 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Snx25Q3ZT31 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx25Q3ZT31 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms