Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ulk4Q3V129 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ulk4Q3V129 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms