Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm10Q3UTQ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm10Q3UTQ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms