Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm6899Q3USS0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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