Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Rbm20Q3UQS8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Rbm20Q3UQS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rbm20Q3UQS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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