Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ankrd27Q3UMR0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ankrd27Q3UMR0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms