Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fam83fQ3UKU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam83fQ3UKU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms