Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smu1Q3UKJ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smu1Q3UKJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms