Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc61Q3UJV1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc61Q3UJV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms