Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnep1r1Q3UJ81 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnep1r1Q3UJ81 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms