Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnrc6cQ3UHC0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms