Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnft2Q3UF64 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnft2Q3UF64 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms