Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trafd1Q3UDK1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trafd1Q3UDK1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms