Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll12Q3UDE2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll12Q3UDE2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms