Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U595 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U595 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U595 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U595 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U595 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q3U595 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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