Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U1D9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U1D9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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