Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trappc9Q3U0M1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc9Q3U0M1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms