Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hace1Q3U0D9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hace1Q3U0D9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms