Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc28Q3TX51 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms