Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q3TTL0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms