Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TQQ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TQQ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms