Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Smarca4Q3TKT4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Smarca4Q3TKT4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Smarca4Q3TKT4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms