Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp444Q3TDV8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp444Q3TDV8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms