Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Jmjd8Q3TA59 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd8Q3TA59 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms