Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpm1Q2TV84 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpm1Q2TV84 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpm1Q2TV84 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms