Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tdrd9Q14BI7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tdrd9Q14BI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms