Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ptchd1Q14B62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ptchd1Q14B62 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ptchd1Q14B62 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ptchd1Q14B62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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ptchd1Q14B62 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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