Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim24Q0VG18 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim24Q0VG18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms