Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp2b3Q0VF55 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp2b3Q0VF55 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms