Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spata18Q0P557 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spata18Q0P557 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms