Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrioQ0KL02 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrioQ0KL02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms